Estudio Bioinformático de Genes y Genomas Microbianos Asociados a Exposición a Fármacos Ambientales

La contaminación por fármacos emergentes en aguas y suelos ecuatorianos representa un desafío crítico para la salud pública y la biodiversidad, al favorecer la resistencia antimicrobiana (RAM). Este proyecto aborda la falta de información sobre la diseminación ecológica de microorganismos resistentes en el país mediante un enfoque interdisciplinario que combina microbiología ambiental, biotecnología y bioinformática. La metodología se divide en dos fases: primero, un análisis bioinformático de genomas microbianos obtenidos de bases de datos públicas para identificar perfiles de resistencia y tolerancia a fármacos; segundo, la reactivación y caracterización genómica de cepas aisladas previamente de muestras ambientales ecuatorianas. Se utilizarán herramientas como FastQC, Trimmomatic, SPADES, Prokka y RASTtk para el ensamblaje y anotación funcional de los genomas. Los resultados esperados incluyen la identificación de genes específicos de resistencia y rutas metabólicas de degradación de contaminantes. Este conocimiento permitirá sentar las bases para el desarrollo de estrategias de biorremediación y nuevas terapias antimicrobianas, contribuyendo a la gestión ambiental sostenible y a la mitigación de riesgos sanitarios asociados a patógenos multirresistentes en el entorno nacional. Objetivo: Realizar un estudio bioinformático de genes y genomas microbianos aislados de ecosistemas ecuatorianos para identificar mecanismos de resistencia a fármacos ambientales. El proyecto busca comprender la adaptación bacteriana y proponer estrategias biotecnológicas sostenibles para la descontaminación. Líneas de investigación: Biodiversidad y recursos genéticos